Платформа доступа Института радиофизики и электроники им. А.Я. Усикова НАН Украины в настоящее время представляет собой beowulf кластер, состоящий из 10 вычислительных узлов и одного управляющего. Пользователям для расчетов доступны 80 процессорных ядер, поддерживаются технологии MPI и OpenMP. Для управления загрузкой узлов используется локальный менеджер ресурсов Torque в связке с планировщиком MAUI.

Управляющий узел кластера:

2x Intel® Xeon® CPU 5420, 16Gb RAM, 2TB RAID5 HDD-массив Операционная система: Linux Slackware 12.2.0, ядро 2.6.27.7 i686. Узел выполняет функции точки входа для пользователей, а так же поддерживает ключевые сервисы: Torque, MAUI, NFS-server. Установлены компиляторы языков C/C++, Fortran, и популярные математические библиотеки (gcc 4.2.4, Intel MKL, ATLAS 3.8.3 и др.)

Вычислительные узлы:

2x Intel® Xeon® CPU 5420, 16Gb memory, 160Gb HDD Операционная система: Linux Slackware 13.0, ядро 2.6.27.7 i686. Локальный диск используется только для хранения временных файлов задач.

Внутренняя сеть кластера построена на основе Infiniband DDR с пропускной способностью около 20Гб/c.

Программное обеспечение

Amber — пакет программ для молекулярной динамики белков и нуклеиновых кислот.

Octave — высоко уровневый интерпретируемый язык, в первую очередь предназначен для численных расчетов. Octave предоставляет возможности для численного решения линейных и нелинейных задач, а также для выполнения других численных экспериментов. В Octave язык очень похож на Matlab.

Gamess — программа пакета вычислительной квантовой химии. Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System.